NCBI

• NCBI: National Center for Biotechnology Information

  • 世界上最多人使用的整合型生物資訊網站
    • 隸屬美國國立衛生研究院 National Institutes of Health（NIH）: 全世界最大的生物醫學研究單位
  • 設立的宗旨: 維持DNA序列資料庫—GeneBack的順利運作
    • 與其他核酸資料庫交流如EMBL 及DDBJ
    • 慢慢擴大包括：
      • （1）PubMad—包含Medline的文獻資料；
      • （2）Entrez—搜尋NCBI資料庫資料的搜索引擎；
      • （3）BLAST—分析DNA與蛋白質序列的快速尋找序列機制；
      • （4）OMIM—人類基因與遺傳性疾病的關連資料庫；
      • （5）Taxonomy Brower─生物物種之分類資料；
      • （6）Structure—3D結構資料庫。
  • NCBI主要分成三個部門：
    • 計算生物學部門 Computational Biology Branch（CBB）掌管
      • 處理運算、數學及分子生物、生物與遺傳學理論問題的基礎與應用研究，包
        • 基因體分析
        • 序列比對
        • 序列搜尋方法
        • 巨分子結構
        • 動力學與交互作用、結構/功能預測
    • 資訊工程部門 Information Engineering Branch（IEB）負責
      • 資料表現與分析的應用研究，
      • 設計分子生物資訊的資料庫架構與規格及呈現
      • 發展分散式軟體系統及整合資料庫
    • 資訊資源部門 Information Resources Branch（IRB）負責
      • 管理電腦設備及系統
      • 擔任計畫執行者及NCBI間的負責人

Reference:

• NCBI: National Center for Biotechnology Information
  • Home - PubMed - NCBI
    • MeSH Browser
• 生物資訊 (Bioinformatics) 專題（下）
• A Brief History of NCBI’s Formation and Growth